Lug 16, 2024

Metaproteomics Methods and Protocols

Le discipline “omiche” sono approcci scientifici basati sulla  determinazione e l’elaborazione di un numero elevato di dati e sequenze  biologiche, anche attraverso comparazioni con database continuamente  aggiornati. Negli ultimi anni, l’obiettivo si è spostato da  sequenziamenti di macromolecole biologiche per singoli organismi modello  in condizioni controllate a determinazione realistiche di macromolecole  appartenenti a intere comunità microbiche conviventi e cooperanti in uno  stesso ambiente (“meta-omiche”).
Dal 2008, il gruppo di studio delle membrane applicate ai trattamenti  biologici di acque reflue del CNR IRSA studia il ruolo delle proteine  nel fango attivo degli impianti di depurazione per via della loro multifunzionalità (catalitica, sensoriale, strutturale, metabolica, ecc.) adottando la proteomica delle comunità microbiche (metaproteomica)  per la caratterizzazione funzionale di fanghi attivi in diversi contesti.
Grazie a quest’esperienza, Carlo Salerno, uno dei ricercatori  interessati in quest’attività, è stato invitato a curare il volume  “Metaproteomics – Methods and Protocols”, per il quale ha coinvolto  esperti internazionali e responsabili di laboratori di metaproteomica in  ambienti e situazioni differenti.
Nel volume, vengono prima descritte le diverse tecniche di estrazione  delle proteine da vari ambienti e tipologie di campione, successivamente  sono presentati completi workflow sperimentali in diversi casi, e infine  sono illustrati vari strumenti bioinformatici per un’ottimale  rielaborazione dei dati ottenuti.
Trovate maggiori dettagli sul volume al link

 

More News…