| Text | 484925 2022 biobanche collezioni digitali collezioni vegetali e microbiche Progetto Biomemory/CNR DiSBA relazione I semestre Gabriele Bucci; Massimo Ianigro CNR IBBR; CNR IRSA 1. Premessa Il progetto BioMemory, finanziato dal CNR DiSBA e giunto al suo sesto mese di attivita, prevede i seguenti obbiettivi per il primo anno 1 l aggiornamento della rete di biobanche BioGenRes http // biogenres.cnr.it di campioni di specie animali, vegetali o microrganismi; 2 lo sviluppo di una piattaforma informatica per la consultazione dei dati delle differenti biobanche e la definizione dei criteri di fruizione dei singoli dati; 3 la replicazione ringiovanimento e la caratterizzazione molecolare, metabolica e fenotipica del materiale conservato nelle biobanche. La presente relazione illustra i risultati ottenuti nei primi sei mesi di attivita del progetto. Al fine di ottimizzare lo svolgimento delle attivita previste e di pervenire agli obbiettivi suddetti, sono stati creati fin dall inizio tre Gruppi di Lavoro GdL , rispettivamente GdL Conservazione vedi sezione 2 , coordinato dal Dott. Giancarlo Perrone CNR ISPA, Bari ; GdL Caratterizzazione sezione 3 , coordinato dalla Dott.ssa Giovanna Frugis CNR IBBA, Montelibretti, RM ; GdL Messa a rete Networking vedi sezione 4 , coordinato dal Dott. Gabriele Bucci CNR IBBR, Sesto Fiorentino, FI . Ciascun GdL e costituito dai responsabili di ciascuno dei nove Istituti affe renti al CNR DiSBA IBBA, IBBR, IBE, IPSP, ISA, ISB, ISAFOM, ISPA, ISPAAM , incaricati dai rispettivi direttori, con il supporto di personale informatico tecnologico di altri istituti IRSA, IRCRES vedi sezione 4 . L obiettivo 1 ha richiesto un iniziale censimento delle attuali collezioni presenti presso gli istituti del CNR DiSBA, che e tuttora in fase di completamento e che sara propedeutico alle attivita di inventariazione/digitalizzazione delle collezioni. Rispetto al precedente censimento confluito nel progetto BioGenRes 166,239 accessioni in 42 collezioni da 10 istituti , i risultati preliminari del censimento BioMemory indicano un aumento del materiale biologico conservato, nonostante il minor numero di istituti coinvolti nel progetto attese 180,000 accessioni circa da 54 collezioni di 9 istituti . Le attivita svolte nell ambito dell obiettivo 2 hanno mirato soprattutto a i valutare lo stato di digitalizzazione attuale delle biobanche/collezioni presenti nell ambito CNR DiSBA; ii predi sporre le condizioni, le funzionalita e le strutture volte ad integrare le attivita del presente progetto con le diverse iniziative nazionali ed internazionali nel settore delle reti infrastrutturali a carattere scientifico ad es., ITINERIS, DiSSCo, PRO GRACE, ecc. ; iii realizzare una piattaforma infor matica in grado di assicurare lo scambio dati in tempo reale con i maggiori aggregatori online di metadati sulla biodiversita ad es., GBIF, EURISCO, ecc. . Le attivita relative all obiettivo 3 sono state mirate a raccogliere informazioni circa le compe tenze presenti presso gli istituti coinvolti nel progetto e le metodologie d indagine utilizzate sulle accessioni delle biobanche. Una prima analisi ha messo in evidenza un elevata qualita della ricerca attualmente condotta sul materiale biologico conservato presso gli istituti del Dipartimento, i cui risultati confermano come le collezioni biologiche attualmente presenti presso la rete di istituti CNR DiSBA siano una preziosa fonte di diversita genetica e funzionale. La caratterizzazione mole 2/44 Progetto BioMemory/CNR DiSBA Relazione semestrale delle attivita colare delle accessioni condotta per molte delle biobanche DiSBA e la necessaria premessa per la creazione di un esteso dataset genetico, genomico, biochimico, proteomico e metabolomico che verra implementato nel corso dei successivi anni di progetto. Tra le attivita di maggior rilievo svoltesi nel primo semestre del progetto ed in via di completa mento durante il secondo semestre vi e la messa a punto e la condivisione di protocolli, strumenti, workflows e procedure utili alla gestione, al mantenimento e alla conservazione del materiale biolo gico presente nelle collezioni/biobanche CNR DiSBA. L adozione di tali standard e fondamentale in vista dell integrazione del network delle collezioni in un contesto di ricerca internazionale, dati gli elevati standard richiesti per la partecipazione a progetti e reti infrastrutturali, che attualmente non tutte le biobanche CNR possiedono. I primi sei mesi di attivita del progetto BioMemory hanno inoltre permesso la creazione di un net work di ricercatori e tecnici coinvolti nella gestione delle biobanche CNR in totale 124 unita di per sonale, al momento della redazione di questo documento, distribuite in tutta la penisola vedi https //biomemory.cnr.it/browse/people che costituiscono un patrimonio di expertise, competenze e conoscenze in grado di assicurare il successo del progetto ed il raggiungimento degli obiettivi previ sti alla fine del triennio. A questo riguardo, le riunioni di progetto che si sono svolte in modalita remota a causa delle restrizioni sanitarie in atto hanno visto un ampia partecipazione ed una fattiva collaborazione da parte di tutti i partecipanti vedi sezione 2 . Il materiale prodotto durante il primo semestre del presente progetto inclusa la presente rela zione e disponibile online in parte sul sito web del progetto https //biomemory.cnr.it ed in parte presso un deposito elettronico remoto condiviso tra tutti i partecipanti al progetto stesso https //bio memory.cnr.it/nextcloud/index.php/s/2HALLP4fFNS8Dkb , presso cui e anche possibile visualiz zare le registrazioni delle riunioni telematiche di coordinamento delle attivita progettuali, in confor mita con le vigenti disposizioni sulla privacy GDPR https //gdpr info.eu/ . https //biomemory.cnr.it Rapporto intermedio di progetto Rapporto di progetto Project report massimo.ianigro IANIGRO MASSIMO gabriele.bucci BUCCI GABRIELE |
