| Text | 440073 2020 10.2807/1560 7917.ES.2020.25.32.2001410 Scopus 2 s2.0 85089543989 SARS_CoV 2 Wastewater Geographical and temporal distribution of SARS CoV 2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 Alm E.; Broberg E.K.; Connor T.; Hodcroft E.B.; Komissarov A.B.; Maurer Stroh S.; Melidou A.; Neher R.A.; O Toole A.; Pereyaslov D.; Beerenwinkel N.; Posada Cespedes S.; Jablonski K.P.; Ferreira P.F.; Topolsky I.; Avsic Zupanc T.; Korva M.; Poljak M.; Zakotnik S.; Zorec T.M.; Bragstad K.; Hungnes O.; Stene Johansen K.; Reusken C.; Meijer A.; Vennema H.; Ruiz Roldan L.; Bracho M.A.; Garcia Gonzalez N.; Chiner Oms A.; Cancino Munoz I.; Comas I.; Goig G.A.; Torres Puente M.; Lopez M.G.; Martinez Priego L.; D Auria G.; Ruiz Hueso P.; Ferrus Abad L.; de Marco G.; Galan Vendrell I.; Carbo Ramirez S.; Ruiz Rodriguez P.; Coscolla M.; Polackova K.; Kramna L.; Cinek O.; Richter J.; Krashias G.; Tryfonos C.; Bashiardes S.; Koptides D.; Christodoulou C.; Bartolini B.; Gruber C.E.; Di Caro A.; Castilletti C.; Stefani F.; Rimoldi S.G.; Romeri F.; Salerno F.; Polesello S.; Nagy A.; Jirincova H.; Vecerova J.; Novakova L.; Cordey S.; Murtskhvaladze M.; Kotaria N.; Schar T.; Beisel C.; Vugrek O.; Rokic F.; Trgovec Greif L.; Jurak I.; Rukavina T.; Sucic N.; Schonning K.; Karst S.M.; Kirkegaard R.H.; Michaelsen T.Y.; Sorensen E.A.; Knutson S.; Brandt J.; Le Quy V.; Sorensen T.; Petersen C.; Pedersen M.S.; Larsen S.L.; Skov M.N.; Rasmussen M.; Fonager J.; Fomsgaard A.; Maksyutov R.A.; Gavrilova E.V.; Pyankov O.V.; Bodnev S.A.; Tregubchak T.V.; Shvalov A.N.; Antonets D.V.; Resende P.C.; Goya S.; Perrin A.; Lee R.T.; Yadahalli S.; Han A.X.; Russell C.A.; Schmutz S.; Zaheri M.; Kufner V.; Huber M.; Trkola A.; Antwerpen M.; Walter M.C.; van der Werf S.; Gambaro F.; Behillil S.; Enouf V.; Donati F.; Ustinova M.; Rovite V.; Klovins J.; Savicka O.; Wienecke Baldacchino A.K.; Ragimbeau C.; Fournier G.; Mossong J.; Aberle S.W.; Haukland M.; Enkirch T.; Advani A.; Karlberg M.L.; Lindsjo O.K.; Broddesson S.; Slavikova M.; Lickova M.; Klempa B.; Staronova E.; Ticha E.; Szemes T.; Rusnakova D.; Stadler T.; Quer J.; Anton A.; Andres C.; Pinana M.; Garcia Cehic D.; Pumarola T.; Izopet J.; Gioula G.; Exindari M.; Papa A.; Chatzidimitriou D.; Metallidis S.; Pappa S.; Macek M.; Geryk J.; Broz P.; Briksi A.; Hubacek P.; Drevinek P.; Zajac M.; Kvapil P.; Holub M.; Kvapilova K.; Novotny A.; Kasny M.; Klempt P.; Vapalahti O.; Smura T.; Sironen T.; Selhorst P.; Anthony C.; Arien K.; Simon Loriere E.; Rabalski L.; Bienkowska Szewczyk K.; Borges V.; Isidro J.; Gomes J.P.; Guiomar R.; Pechirra P.; Costa I.; Duarte S.; Vieira L.; Pyrc K.; Zuckerman N.S.; Turdikulova S.; Abdullaev A.; Dalimova D.; Abdurakhimov A.; Tagliabracci A.; Alessandrini F.; Melchionda F.; Onofri V.; Turchi C.; Bagnarelli P.; Menzo S.; Caucci S.; Di Sante L.; Popa A.; Genger J. W.; Agerer B.; Lercher A.; Endler L.; Smyth M.; Penz T.; Schuster M.; Senekowitsch M.; Laine J.; Bock C.; Bergthaler A.; Shevtsov A.; Kalendar R.; Ramanculov Y.; Graf A.; Muenchhoff M.; Keppler O.T.; Krebs S.; Blum H.; Marcello A.; Licastro D.; D Agaro P.; Laubscher F.; Vidanovic D.; Tesovic B.; Volkening J.; Clementi N.; Mancini N.; Rupnik M.; Mahnic A.; Walker A.; Houwaart T.; Wienemann T.; Vasconcelos M.K.; Strelow D.; Jensen B. E.O.; Senff T.; Hulse L.; Adams O.; Andree M.; Hauka S.; Feldt T.; Keitel V.; Kindgen Milles D.; Timm J.; Pfeffer K.; Dilthey A.T.; Moore C.; Ozdarendeli A.; Pavel S.T.I.; Yetiskin H.; Aydin G.; Holyavkin C.; Uygut M.A.; Cevik C.; Shchetinin A.; Gushchin V.; Dinler Doganay G.; Doganay L.; Kizilboga Akgun T.; Karacan I.; Pancer K.; Maes P.; Marti Carreras J.; Wawina Bokalanga T.; Vanmechelen B.; Thurmer A.; Wedde M.; Durrwald R.; von Kleist M.; Drechsel O.; Wolff T.; Fuchs S.; Kmiecinski R.; Michel J.; Nitsche A.; Casas I.; Caballero M.I.; Zaballos A.; Jimenez P.; Jimenez M.; Fernandez S.M.; Fernandez S.V.; de la Plaza I.C.; Fadeev A.; Ivanova A.; Sergeeva M.; Stefanelli P.; Estee Torok M.; Hall G.; da Silva Filipe A.; Turtle L.; Afifi S.; McCluggage K.; Beer R.; Ledesma J.; Maksimovic J.; Spellman K.; Hamilton W.L.; Marchbank A.; Southgate J.A.; Underwood A.; Taylor B.; Yeats C.; Abudahab K.; Gemmell M.R.; Eccles R.; Lucaci A.; Nelson C.A.; Rainbow L.; Whitehead M.; Gregory R.; Haldenby S.; Paterson S.; Hughes M.A.; Curran M.D.; Baker D.; Tucker R.; Green L.R.; Feltwell T.; Halstead F.D.; Wyles M.; Jahun A.S.; Ahmad S.S.Y.; Georgana I.; Goodfellow I.; Yakovleva A.; Meredith L.W.; Gavriil A.; Awan A.R.; Fisher C.; Edgeworth J.; Lynch J.; Moore N.; Williams R.; Kidd S.P.; Cortes N.; Brunker K.; McCrone J.T.; Quick J.; Duckworth N.; Walsh S.; Sloan T.; Ludden C.; George R.P.; Eltringham G.; Brown J.R.; Aranday Cortes E.; Shepherd J.G.; Hughes J.; Li K.K.; Williams T.C.; Johnson N.; Jesudason N.; Mair D.; Thomson E.; Shah R.; Parr Y.A.; Carmichael S.; Robertson D.L.; Nomikou K.; Broos A.; Niebel M.; Smollett K.; Tong L.; Miah S.; Wittner A.; Phillips N.; Payne B.; Dewar R.; Holmes A.; Bolt F.; Price J.R.; Mookerjee S.; Sethi D.K.; Potter W.; Stanley R.; Prakash R.; Dervisevic S.; Graham J.C.; Nelson A.; Smith D.; Young G.R.; Yew W.C.; Todd J.A.; Trebes A.; Andersson M.; Bull M.; Watkins J.; Birchley A.; Gatica Wilcox B.; Gilbert L.; Kumziene Summerhayes S.; Rey S.; Chauhan A.; Butcher E.; Bicknell K.; Elliott S.; Glaysher S.; Lackenby A.; Bibby D.; Platt S.; Mohamed H.; Machin N.W.; Mbisa J.L.; Evans J.; Perry M.; Pacchiarini N.; Corden S.; Adams A.G.; Gaskin A.; Coombs J.; Graham L.J.; Cottrell S.; Morgan M.; Gifford L.; Kolyva A.; Rudder S.J.; Trotter A.J.; Mather A.E.; Aydin A.; Page A.J.; Kay G.L.; de Oliveira Martins L.; Yasir M.; Alikhan N. F.; Thomson N.M.; Gilroy R.; Kingsley R.A.; O Grady J.; Gutierrez A.V.; Diaz M.; Viet T.L.; Tedim A.P.; Adriaenssens E.M.; Patrick Mcclure C.; Moore C.; Sang F.; Clark G.; Howson Wells H.C.; Debebe J.; Ball J.; Chappell J.; Khakh M.; Carlile M.; Loose M.; Lister M.M.; Holmes N.; Tsoleridis T.; Fleming V.M.; Wright V.; Smith W.; Gallagher M.D.; Parker M.; Partridge D.G.; Evans C.; Baker P.; Essex S.; Liggett S.; Keeley A.J.; Bashton M.; Rooke S.; Dervisavic S.; Meader E.J.; Lopez C.E.B.; Angyal A.; Kristiansen M.; Tutill H.J.; Findlay J.; Mestek Boukhibar L.; Forrest L.; Dyal P.; Williams R.J.; Panchbhaya Y.; Williams C.A.; Roy S.; Pandey S.; Stockton J.; Loman N.J.; Poplawski R.; Nicholls S.; Rowe W.P.M.; Khokhar F.; Pinckert M.L.; Hosmillo M.; Chaudhry Y.; Caller L.G.; Davidson R.K.; Griffith L.; Rambaut A.; Jackson B.; Colquhoun R.; Hill V.; Nichols J.; Asamaphan P.; Darby A.; Jackson K.A.; Iturriza Gomara M.; Vamos E.E.; Green A.; Aanensen D.; Bonsall D.; Buck D.; Macintyre Cockett G.; de Cesare M.; Pybus O.; Golubchik T.; Scarlett G.; Loveson K.F.; Robson S.C.; Beckett A.; Lindsey B.; Groves D.C.; Parsons P.J.; McHugh M.P.; Barnes J.D.; Manso C.F.; Grammatopoulos D.; Menger K.E.; Harrison E.; Gunson R.; Peacock S.J.; Gonzalez G.; Carr M.; Mihaela L.; Popovici O.; Brytting M.; Bresner C.; Fuller W.; Workman T.; Mentis A.F.; Kossyvakis A.; Karamitros T.; Pogka V.; Kalliaropoulos A.; Horefti E.; Kontou A.; Martinez Gonzalez B.; Labropoulou V.; Voulgari Kokota A.; Evangelidou M.; Bizta P.; Belimezi M.; Lambrechts L.; Doymaz M.Z.; Yazici M.K.; Cetin N.S.; Karaaslan E.; Kallio Kokko H.; Virtanen J.; Suvanto M.; Nguyen P.T.; Ellonen P.; Hannula S.; Kangas H.; Sreenu V.B.; Burian K.; Terhes G.; Gombos K.; Gyenesei A.; Urban P.; Herczeg R.; Jakab F.; Kemenesi G.; Toth G.E.; Somogyi B.; Zana B.; Zeghbib S.; Kuczmog A.; Foldes F.; Lanszki Z.; Madai M.; Papp H.; Nagy A.; Pereszlenyi C.I.; Babinszky G.C.; Dudas G.; Csoma E.; Abou Tayoun A.N.; Alsheikh Ali A.A.; Loney T.; Nowotny N.; Abdul Wahab O.; Gonzalez Candelas F.; Andersen M.H.; Taylor S. European Centre for Disease Prevention and Control, Stockholm, The European Centre for Disease Prevention and Control, Stockholm, Sweden, , Sweden; Public Health Wales Microbiology, Cardiff, Public Health Wales Microbiology, Cardiff, United Kingdom, , United Kingdom; Cardiff University, School of Biosciences, Cardiff, Cardiff University School of Biosciences, Cardiff, United Kingdom, , , United Kingdom; Cardiff University, School of Biosciences, Cardiff, Cardiff University School of Biosciences, Cardiff, United Kingdom, , , United Kingdom; Biozentrum, University of Basel, Basel, Biozentrum, University of Basel, Basel, Switzerland, , Switzerland; Smorodintsev Research Institute of Influenza, Saint Petersburg, Smorodintsev Research Institute of Influenza, Saint Petersburg, Russian Federation, , Russian Federation; Bioinformatics Institute, Agency for Science Technology and Research, Singapore, Bioinformatics Institute, Agency for Science Technology and Research, Singapore, Singapore, , , Singapore; Bioinformatics Institute, Agency for Science Technology and Research, Singapore, Bioinformatics Institute, Agency for Science Technology and Research, Singapore, Singapore, , , Singapore; Department of Biological Sciences, National University of Singapore, Singapore, Department of Biological Sciences, National University of Singapore, Singapore, Singapore, , Singapore; National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases, Ministry of Health, Singapore, National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases, Ministry of Health, Singapore, Singapore, , Singapore; Global Initiative on Sharing All Influenza Data GISAID , Munich, Global Initiative on Sharing All Influenza Data GISAID , Munich, Germany, , Germany; University of Edinburgh, Edinburgh, University of Edinburgh, Edinburgh, United Kingdom, , United Kingdom; Health Emergency Programme, WHO Regional Office for Europe, Copenhagen, Health Emergency Programme, WHO Regional Office for Europe, Copenhagen, Denmark, , Denmark We show the distribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 SARS CoV 2 genetic clades over time and between countries and outline potential genomic surveillance objectives. We applied three genomic nomenclature systems to all sequence data from the World Health Organization European Region available until 10 July 2020. We highlight the importance of real time sequencing and data dissemination in a pandemic situation, compare the nomenclatures and lay a foundation for future European genomic surveillance of SARS CoV 2. 25 Published version http //www.scopus.com/record/display.url eid=2 s2.0 85089543989 origin=inward paper eurosurv 25 32 2.pdf Articolo in rivista Publications Office, 1025 496X Euro surveillance Euro surveillance Euro surveill. Euro surveillance. Eurosurveillance stefano.polesello POLESELLO STEFANO franco.salerno SALERNO FRANCO fabrizio.stefani STEFANI FABRIZIO |
