Scheda di dettaglio – i prodotti della ricerca
| Dato | Valore |
|---|---|
| Title | Nuove prospettive dell'ecologia microbica dei laghi: la visione da uno storico istituto |
| Abstract | Gli organismi attori nella catena trofica microbica sono i virus, i Bacteria, gli Archaea, il picoplancton autotrofo, il fitoplancton, i flagellati eterotrofi ed i ciliati. L'ecologia microbica acquatica studia le interazioni tra di essi e l'ambiente che li ospita, anche alla luce delle cospicue modificazioni biogeofisiche che i microorganismi possono determinare nell'ecosistema. A cominciare dagli anni '90 l'approccio molecolare allo studio delle comunità microbiche ha portato a nuove conoscenze della diversità microbica e delle linee filogenetiche dei microrganismi acquatici. Si è cominciato a chiarire che l'importanza dei microrganismi nell'ecosistema lago aumenta parallelamente alla comprensione delle relazioni tra funzione ed identità tassonomica. Perciò gli sforzi della ricerca sono stati indirizzati verso il sequenziamento dell'intero genoma, grazie alla facilitata accessibilità alle tecniche di sequenziamento di ultima generazione. La metagenomica ha reso possibile l'ampliamento del numero di sequenze del gene 16S rRNA depositate e ha dato nuovo impulso per la comprensione della composizione e dell'ecologia delle comunità microbiche. C'è bisogno tuttavia di migliorare le misure a microscala (nanometro e millimetro) per comprendere le interazioni e le funzioni microbiche, di isolare batteri, archea e virus e di coltivare comunità miste. Nell'Istituto Italiano di Idrobiologia, ora CNR - ISE, le ricerche nel campo dell'ecologia microbica hanno avuto già dagli anni '60 un'importanza riconosciuta anche internazionalmente. L'attuale gruppo di ecologia microbica acquatica è al passo con i tempi ed ha focalizzato le indagini su numerosi temi d'avanguardia. Illustrerò a titolo d'esempio tre "case studies" che descrivono al meglio la nostra ricerca nel campo: 1) Diversità filogenetica dei picocianobatteri di acqua dolce, 2) Dinamiche di formazione di microcolonie da cellule singole di Synechococcus, 3) Thaumarchaeota nell'ipolimnio profondo dei laghi subalpini. |
| Source | AIOL: XXI Congresso dell'Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia: Limnologia e Oceanografia nel Terzo Millennio: nuove frontiere o assenza di frontiere?, Lignano Sabbiadoro (UD), 23-26 settembre 2013 |
| Keywords | Ecologia microbica acquaticaIstituto Italiano di IdrobiologiaPicocianobatteriArchaea |
| Year | 2013 |
| Type | Presentazione |
| Authors | Cristiana Callieri |
| Text | 282599 2013 Ecologia microbica acquatica Istituto Italiano di Idrobiologia Picocianobatteri Archaea Nuove prospettive dell ecologia microbica dei laghi la visione da uno storico istituto Cristiana Callieri CNR ISE VB Gli organismi attori nella catena trofica microbica sono i virus, i Bacteria, gli Archaea, il picoplancton autotrofo, il fitoplancton, i flagellati eterotrofi ed i ciliati. L ecologia microbica acquatica studia le interazioni tra di essi e l ambiente che li ospita, anche alla luce delle cospicue modificazioni biogeofisiche che i microorganismi possono determinare nell ecosistema. A cominciare dagli anni 90 l approccio molecolare allo studio delle comunita microbiche ha portato a nuove conoscenze della diversita microbica e delle linee filogenetiche dei microrganismi acquatici. Si e cominciato a chiarire che l importanza dei microrganismi nell ecosistema lago aumenta parallelamente alla comprensione delle relazioni tra funzione ed identita tassonomica. Percio gli sforzi della ricerca sono stati indirizzati verso il sequenziamento dell intero genoma, grazie alla facilitata accessibilita alle tecniche di sequenziamento di ultima generazione. La metagenomica ha reso possibile l ampliamento del numero di sequenze del gene 16S rRNA depositate e ha dato nuovo impulso per la comprensione della composizione e dell ecologia delle comunita microbiche. C e bisogno tuttavia di migliorare le misure a microscala nanometro e millimetro per comprendere le interazioni e le funzioni microbiche, di isolare batteri, archea e virus e di coltivare comunita miste. Nell Istituto Italiano di Idrobiologia, ora CNR ISE, le ricerche nel campo dell ecologia microbica hanno avuto gia dagli anni 60 un importanza riconosciuta anche internazionalmente. L attuale gruppo di ecologia microbica acquatica e al passo con i tempi ed ha focalizzato le indagini su numerosi temi d avanguardia. Illustrero a titolo d esempio tre case studies che descrivono al meglio la nostra ricerca nel campo 1 Diversita filogenetica dei picocianobatteri di acqua dolce, 2 Dinamiche di formazione di microcolonie da cellule singole di Synechococcus, 3 Thaumarchaeota nell ipolimnio profondo dei laghi subalpini. Published version In AIOL XXI Congresso dell Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia Limnologia e Oceanografia nel Terzo Millennio nuove frontiere o assenza di frontiere Lignano Sabbiadoro UD , 23 26 settembre 2013 . AIOL XXI Congresso dell Associazione Italiana di Oceanologia e Limnologia Limnologia e Oceanografia nel Terzo Millennio nuove frontiere o assenza di frontiere Lignano Sabbiadoro UD 23 26 settembre 2013 Internazionale Contributo PPT PPT_AIOL_Callieri_storico_istituto.pdf Presentazione cristiana.callieri CALLIERI CRISTIANA TA.P04.016.004 Ecologia teorica e applicata degli ecosistemi acquatici |